Protein–RNA interactions for Protein: P48757

Gast, Gastrin, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GastP48757 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GastP48757 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GastP48757 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GastP48757 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GastP48757 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GastP48757 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GastP48757 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GastP48757 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GastP48757 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GastP48757 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GastP48757 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GastP48757 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GastP48757 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GastP48757 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GastP48757 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GastP48757 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GastP48757 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GastP48757 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GastP48757 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GastP48757 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GastP48757 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GastP48757 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GastP48757 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GastP48757 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GastP48757 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GastP48757 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GastP48757 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GastP48757 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GastP48757 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GastP48757 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GastP48757 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GastP48757 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GastP48757 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GastP48757 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GastP48757 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GastP48757 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GastP48757 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GastP48757 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GastP48757 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GastP48757 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GastP48757 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GastP48757 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GastP48757 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GastP48757 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GastP48757 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GastP48757 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GastP48757 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GastP48757 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GastP48757 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GastP48757 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GastP48757 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GastP48757 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GastP48757 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GastP48757 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GastP48757 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GastP48757 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GastP48757 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GastP48757 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GastP48757 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GastP48757 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GastP48757 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GastP48757 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GastP48757 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GastP48757 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GastP48757 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GastP48757 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GastP48757 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GastP48757 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GastP48757 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GastP48757 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GastP48757 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GastP48757 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GastP48757 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GastP48757 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GastP48757 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GastP48757 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GastP48757 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GastP48757 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GastP48757 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GastP48757 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GastP48757 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GastP48757 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GastP48757 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GastP48757 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GastP48757 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GastP48757 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GastP48757 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GastP48757 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GastP48757 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GastP48757 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GastP48757 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GastP48757 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GastP48757 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GastP48757 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GastP48757 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GastP48757 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GastP48757 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GastP48757 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GastP48757 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GastP48757 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms