Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb41P48193 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb41P48193 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb41P48193 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb41P48193 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms