Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nedd4P46935 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms