Protein–RNA interactions for Protein: P41272

Cd27, CD27 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd27P41272 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd27P41272 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd27P41272 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd27P41272 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd27P41272 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd27P41272 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd27P41272 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd27P41272 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd27P41272 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd27P41272 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd27P41272 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd27P41272 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd27P41272 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd27P41272 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd27P41272 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd27P41272 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms