Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rom1P32958 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rom1P32958 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rom1P32958 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rom1P32958 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rom1P32958 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rom1P32958 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rom1P32958 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rom1P32958 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rom1P32958 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms