Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp1P29452 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp1P29452 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp1P29452 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp1P29452 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp1P29452 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp1P29452 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms