Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms