Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox4i1P19783 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox4i1P19783 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox4i1P19783 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox4i1P19783 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox4i1P19783 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox4i1P19783 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox4i1P19783 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox4i1P19783 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox4i1P19783 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox4i1P19783 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox4i1P19783 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox4i1P19783 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox4i1P19783 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox4i1P19783 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox4i1P19783 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox4i1P19783 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox4i1P19783 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox4i1P19783 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox4i1P19783 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox4i1P19783 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox4i1P19783 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox4i1P19783 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox4i1P19783 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox4i1P19783 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox4i1P19783 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox4i1P19783 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox4i1P19783 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox4i1P19783 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox4i1P19783 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox4i1P19783 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox4i1P19783 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox4i1P19783 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox4i1P19783 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox4i1P19783 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox4i1P19783 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox4i1P19783 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox4i1P19783 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox4i1P19783 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229.4 ms