Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18525 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18525 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18525 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18525 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18525 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18525 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18525 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18525 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18525 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18525 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18525 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18525 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18525 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18525 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P18525 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P18525 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18525 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18525 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18525 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18525 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18525 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18525 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18525 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18525 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18525 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18525 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P18525 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18525 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18525 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18525 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18525 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18525 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18525 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18525 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18525 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18525 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18525 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18525 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18525 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18525 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18525 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18525 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18525 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18525 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18525 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18525 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18525 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18525 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P18525 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18525 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18525 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18525 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18525 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18525 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18525 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18525 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18525 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18525 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18525 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18525 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18525 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P18525 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18525 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18525 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18525 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18525 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18525 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P18525 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18525 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18525 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18525 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18525 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18525 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18525 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18525 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18525 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18525 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18525 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18525 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18525 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18525 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18525 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18525 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P18525 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18525 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18525 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18525 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18525 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18525 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18525 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18525 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18525 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18525 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18525 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P18525 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18525 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18525 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18525 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18525 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms