Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FlgP11088 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FlgP11088 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FlgP11088 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FlgP11088 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FlgP11088 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FlgP11088 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FlgP11088 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FlgP11088 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FlgP11088 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FlgP11088 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FlgP11088 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FlgP11088 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FlgP11088 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FlgP11088 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FlgP11088 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FlgP11088 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FlgP11088 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FlgP11088 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FlgP11088 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FlgP11088 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FlgP11088 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FlgP11088 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FlgP11088 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FlgP11088 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FlgP11088 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FlgP11088 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FlgP11088 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FlgP11088 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FlgP11088 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FlgP11088 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FlgP11088 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FlgP11088 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FlgP11088 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FlgP11088 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FlgP11088 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FlgP11088 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FlgP11088 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FlgP11088 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FlgP11088 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FlgP11088 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FlgP11088 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FlgP11088 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FlgP11088 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FlgP11088 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FlgP11088 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FlgP11088 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FlgP11088 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FlgP11088 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FlgP11088 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FlgP11088 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FlgP11088 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FlgP11088 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FlgP11088 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FlgP11088 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FlgP11088 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FlgP11088 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FlgP11088 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FlgP11088 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FlgP11088 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FlgP11088 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FlgP11088 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FlgP11088 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FlgP11088 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FlgP11088 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FlgP11088 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FlgP11088 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FlgP11088 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FlgP11088 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FlgP11088 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FlgP11088 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FlgP11088 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FlgP11088 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FlgP11088 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FlgP11088 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FlgP11088 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FlgP11088 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FlgP11088 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FlgP11088 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FlgP11088 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FlgP11088 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FlgP11088 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FlgP11088 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FlgP11088 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FlgP11088 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FlgP11088 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FlgP11088 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FlgP11088 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FlgP11088 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FlgP11088 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FlgP11088 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FlgP11088 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FlgP11088 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FlgP11088 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FlgP11088 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FlgP11088 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FlgP11088 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FlgP11088 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FlgP11088 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FlgP11088 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms