Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
P01678 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01678 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01678 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01678 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01678 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01678 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01678 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01678 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01678 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01678 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01678 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01678 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01678 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01678 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01678 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01678 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01678 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01678 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01678 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01678 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01678 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01678 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01678 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01678 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01678 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01678 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01678 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01678 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01678 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01678 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01678 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01678 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01678 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01678 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01678 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01678 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01678 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01678 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01678 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01678 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01678 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01678 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01678 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01678 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01678 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01678 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01678 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01678 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
P01678 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01678 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01678 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01678 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01678 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01678 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P01678 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01678 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01678 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01678 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01678 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01678 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01678 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01678 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01678 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01678 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01678 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01678 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01678 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01678 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01678 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01678 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01678 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01678 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01678 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01678 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01678 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01678 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01678 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01678 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01678 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01678 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01678 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01678 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01678 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01678 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01678 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01678 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01678 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01678 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01678 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01678 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01678 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01678 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01678 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01678 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01678 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01678 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01678 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01678 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01678 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms