Protein–RNA interactions for Protein: O94761

RECQL4, ATP-dependent DNA helicase Q4, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4O94761 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RECQL4O94761 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RECQL4O94761 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RECQL4O94761 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RECQL4O94761 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RECQL4O94761 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RECQL4O94761 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RECQL4O94761 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RECQL4O94761 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RECQL4O94761 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RECQL4O94761 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RECQL4O94761 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RECQL4O94761 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RECQL4O94761 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RECQL4O94761 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RECQL4O94761 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RECQL4O94761 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RECQL4O94761 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RECQL4O94761 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RECQL4O94761 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms