Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp2O88554 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp2O88554 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp2O88554 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp2O88554 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp2O88554 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Parp2O88554 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp2O88554 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp2O88554 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp2O88554 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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