Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms