Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2f6O54917 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2f6O54917 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2f6O54917 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2f6O54917 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
E2f6O54917 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2f6O54917 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2f6O54917 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2f6O54917 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2f6O54917 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19■□□□□ 0.63
E2f6O54917 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2f6O54917 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2f6O54917 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2f6O54917 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2f6O54917 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2f6O54917 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2f6O54917 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2f6O54917 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms