Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpd52l1O54818 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms