Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20828J3KMI7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20828J3KMI7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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