Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Gm3371F7CQW8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Gm3371F7CQW8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Gm3371F7CQW8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Gm3371F7CQW8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3371F7CQW8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3371F7CQW8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms