Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
6030445D17RikE9Q8F9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
6030445D17RikE9Q8F9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
6030445D17RikE9Q8F9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
6030445D17RikE9Q8F9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
6030445D17RikE9Q8F9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
6030445D17RikE9Q8F9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
6030445D17RikE9Q8F9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms