Protein–RNA interactions for Protein: C9J798

RASA4B, Ras GTPase-activating protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4BC9J798 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASA4BC9J798 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASA4BC9J798 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASA4BC9J798 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASA4BC9J798 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASA4BC9J798 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASA4BC9J798 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASA4BC9J798 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RASA4BC9J798 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASA4BC9J798 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASA4BC9J798 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASA4BC9J798 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASA4BC9J798 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASA4BC9J798 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms