Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms