Protein–RNA interactions for Protein: A2AMD2

Ankrd60, Ankyrin repeat domain 60, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd60A2AMD2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ankrd60A2AMD2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ankrd60A2AMD2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ankrd60A2AMD2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ankrd60A2AMD2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ankrd60A2AMD2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ankrd60A2AMD2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ankrd60A2AMD2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ankrd60A2AMD2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ankrd60A2AMD2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms