Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdc27A2A6Q5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdc27A2A6Q5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdc27A2A6Q5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc27A2A6Q5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc27A2A6Q5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc27A2A6Q5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc27A2A6Q5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc27A2A6Q5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc27A2A6Q5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc27A2A6Q5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc27A2A6Q5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc27A2A6Q5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc27A2A6Q5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc27A2A6Q5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc27A2A6Q5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdc27A2A6Q5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdc27A2A6Q5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdc27A2A6Q5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdc27A2A6Q5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc27A2A6Q5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms