Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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