Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXW11Q9UKB1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms