Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RABGEF1Q9UJ41 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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