Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms