Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PnkpQ9JLV6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PnkpQ9JLV6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PnkpQ9JLV6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PnkpQ9JLV6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PnkpQ9JLV6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PnkpQ9JLV6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms