Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx20Q9JJY4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ddx20Q9JJY4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.8 ms