Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Bco1Q9JJS6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Bco1Q9JJS6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Bco1Q9JJS6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Bco1Q9JJS6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Bco1Q9JJS6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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