Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Swt1Q9DBQ9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.4 ms