Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm5Q9D806 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm5Q9D806 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms