Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc8Q9CYA6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zcchc8Q9CYA6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms