Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkrip1Q9CWV6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkrip1Q9CWV6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkrip1Q9CWV6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117 ms