Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf144aQ925F3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms