Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC37.01■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
TOPBP1Q92547 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC37■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC37■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC37■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms