Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATRIPQ8WXE1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms