Protein–RNA interactions for Protein: Q8R422

Cd109, CD109 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd109Q8R422 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cd109Q8R422 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cd109Q8R422 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cd109Q8R422 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cd109Q8R422 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cd109Q8R422 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cd109Q8R422 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cd109Q8R422 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cd109Q8R422 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cd109Q8R422 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cd109Q8R422 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cd109Q8R422 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cd109Q8R422 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cd109Q8R422 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cd109Q8R422 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cd109Q8R422 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cd109Q8R422 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cd109Q8R422 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cd109Q8R422 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
Cd109Q8R422 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cd109Q8R422 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cd109Q8R422 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cd109Q8R422 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cd109Q8R422 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cd109Q8R422 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cd109Q8R422 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms