Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U4

Hspa12a, Heat shock 70 kDa protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa12aQ8K0U4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspa12aQ8K0U4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspa12aQ8K0U4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms