Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC13Q8IYE1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms