Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lancl3Q8CD19 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lancl3Q8CD19 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lancl3Q8CD19 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lancl3Q8CD19 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lancl3Q8CD19 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lancl3Q8CD19 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms