Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
E4f1Q8CCE9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4f1Q8CCE9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms