Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22cQ8BXT9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22cQ8BXT9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22cQ8BXT9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22cQ8BXT9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22cQ8BXT9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22cQ8BXT9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22cQ8BXT9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22cQ8BXT9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22cQ8BXT9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22cQ8BXT9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22cQ8BXT9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22cQ8BXT9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sec22cQ8BXT9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sec22cQ8BXT9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22cQ8BXT9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22cQ8BXT9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22cQ8BXT9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22cQ8BXT9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22cQ8BXT9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22cQ8BXT9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22cQ8BXT9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22cQ8BXT9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22cQ8BXT9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms