Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssxb10Q6XAR7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssxb10Q6XAR7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssxb10Q6XAR7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssxb10Q6XAR7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssxb10Q6XAR7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssxb10Q6XAR7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssxb10Q6XAR7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssxb10Q6XAR7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssxb10Q6XAR7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssxb10Q6XAR7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssxb10Q6XAR7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssxb10Q6XAR7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssxb10Q6XAR7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Ssxb10Q6XAR7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Ssxb10Q6XAR7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Ssxb10Q6XAR7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssxb10Q6XAR7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssxb10Q6XAR7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssxb10Q6XAR7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssxb10Q6XAR7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssxb10Q6XAR7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssxb10Q6XAR7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssxb10Q6XAR7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssxb10Q6XAR7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssxb10Q6XAR7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssxb10Q6XAR7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssxb10Q6XAR7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssxb10Q6XAR7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssxb10Q6XAR7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssxb10Q6XAR7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssxb10Q6XAR7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssxb10Q6XAR7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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