Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
Mdc1Q5PSV9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms