Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam228bQ497Q6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228bQ497Q6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam228bQ497Q6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms