Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SfswapQ3USH5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SfswapQ3USH5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms