Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TchpQ3TVW5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TchpQ3TVW5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms