Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc10Q3TLI0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc10Q3TLI0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms