Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM28Q13263 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM28Q13263 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
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